Este pacote para o R apresenta funções para download e pré-processamento dos arquivos de microdados do DataSUS (formato DBC). Nesta última etapa, os rótulos e formato das variáveis são atribuídos e tratados.
Instalação
# install.packages("remotes")
remotes::install_github("rfsaldanha/microdatasus")Windows
Para instalar o pacote no Windows, é necessário instalar antes o pacote read.dbc.
Você pode instalar a última versão já compilada para Windows
install.packages("read.dbc", repos = "https://packagemanager.posit.co/cran/2024-07-05")E depois instalar o microdatasus
remotes::install_github("rfsaldanha/microdatasus")Ou instalar o Rtools e compilar locamente.
Utilização
A utilizaço do pacote consiste, em geral, no uso de duas funções: uma realiza o download dos dados e outra o pré-processamento dos mesmos.
Exemplo
library(microdatasus)
dados <- fetch_datasus(year_start = 2013, year_end = 2014, uf = "RJ", information_system = "SIM-DO")
dados <- process_sim(dados)Sistemas de Informação em Saúde suportados
- Download: SIM, SINASC, SIH, CNES, SIA, SINAN-DENGUE, SINAN-CHIKUNGUNYA, SINAN-ZIKA, SINAN-MALARIA.
- Pré-processamento: SIM, SINASC, SIH-RD, CNES-ST, CNES-PF, SINAN-DENGUE, SINAN-CHIKUNGUNYA, SINAN-ZIKA, SINAN-MALARIA.
Agradecimento
O desenvolvimento deste pacote não seria possível sem o pacote read.dbc, criado por Daniela Petruzalek.
Como citar
Peço aos usuários que citem o pacote sempre que ele for utilizado.
SALDANHA, Raphael de Freitas; BASTOS, Ronaldo Rocha; BARCELLOS, Christovam. Microdatasus: pacote para download e pré-processamento de microdados do Departamento de Informática do SUS (DATASUS). Cad. Saúde Pública, Rio de Janeiro , v. 35, n. 9, e00032419, 2019. Available from https://doi.org/10.1590/0102-311x00032419.
Dúvidas e sugestões
Crie uma issue no projeto ou envie um e-mail para raphael.saldanha@fiocruz.br